本次男女主角是采取同時(shí)存在的制度，選擇了其中一人，另一人依然會(huì)出現(xiàn)在故事中，至于是敵是友這就留給玩家們自己發(fā)現(xiàn)吧。機(jī)戰(zhàn)系列帶劇情的方式都是人物立繪或頭像加對(duì)話框，偶爾再穿插音效與音樂(lè)來(lái)表現(xiàn)劇情張力。此外，部份立繪還會(huì)加入細(xì)微的表情變化來(lái)配合劇情。

　　當(dāng)然這種表現(xiàn)方式在現(xiàn)今游戲中略嫌單薄。因此這回加入了相當(dāng)多的過(guò)場(chǎng)動(dòng)畫(huà)演出，特別是《宇宙戰(zhàn)艦大和號(hào)》，在游戲初期的各種演出都足以激起高齡玩家心中的感動(dòng)和期待。 （時(shí)代的眼淚……）

　　本次《機(jī)戰(zhàn)V》故事重點(diǎn)在「航?！?，因此本次故事和《宇宙戰(zhàn)艦大和號(hào)》緊緊相關(guān)，不論男女主角、海盜高達(dá)、蓋塔機(jī)器人、魔神Z等，都在初期跟著大和號(hào)共進(jìn)退。從一開(kāi)始的劇情敘述就可以看出本作故事完全是以《宇宙戰(zhàn)艦大和號(hào)》的主軸延伸出去的，只不過(guò)，這回因?yàn)橛懈鞣N機(jī)器人的加入，大和號(hào)的宇宙旅程也變得更加壯闊。